Стеклянные чашки Петри считаются универсальной посудой для лабораторий, подходящей для проведения исследований и опытов в биологии и химии. Широкое применение емкость получила в микробиологии, ее используют для развития клеточных культур (вирусов, бактерий). Стекло выдерживает высокие температуры различных растворов. Ровная поверхность позволяет жидкости равномерно растекаться по дну.
Для проведения опытов полость стеклянной чашки Петри заполняют специальной питательной средой. При культивировании аэробных видов микроорганизмов используется несколько вентиляционных опор для обеспечения доступа воздуха. Напротив, при выращивании анаэробных культур обязательным условием является изоляция контакта питательной среды с атмосферой.
Чашки Петри из стекла предназначены для многократного применения. После использования емкости необходимо произвести тщательную стерилизацию. Наличие крышки не позволяет составу вытекать из емкости.