Высокопроизводительная система электрофоретического разделения нуклеиновых кислот с использованием микрочиповой технологии. Система позволяет заменить рутинные методы классического гель-электрофореза.
- Минимальный объем образца, мкл — 5 (в режиме смешивания реагентов на микрочипе) или — 6 (при предварительном смешивании с реагентами);
- диапазон измеряемых концентраций ДНК, нг/мкл:
- 0,5 — 50;
- диапазон измеряемых концентраций РНК, нг/мкл:
- 25 — 500 (общая РНК);
- 25 — 250 (матричная РНК);
- предел обнаружения ДНК, нг/мкл — 0,2;
- предел обнаружения РНК, нг/мкл — 5;
- источник света — светодиод, 470 нм;
- кварцевый микрочип, электрофоретической канал длиной 23 мм;
- интегрированные платиновые электроды;
- напряжение — до 1,5 кВ, ток — 250 мкА;
- размеры, Ш x Г x В, мм — 415 × 545 × 508;
- вес, кг — 43.
Области применения:
- генетический анализ нокаутных животных, методами генной инженерии;
- контроль качества библиотек NGS;
- детекция аллергенов в пищевой индустрии;
- генотипирование.
Преимущества:
- одновременный автоматизированный анализ до 108 образцов;
- высокая скорость анализа — до 5 мин;
- высокая чувствительность, благодаря флуориметрическому детектору;
- высокая воспроизводимость результатов;
- отсутствие использования бромистого этидия;
- автоматический ввод образца в микрочип и заполнение электрофоретического канала буферным раствором;
- автоматическая промывка микрочипа до и после измерения;
- специальное покрытие капилляров обеспечивает возможность многократного использования одного и того же микрочипа — до 3600 анализов.
Принцип работы: в системе применяют готовые чипы, заполненные буферным раствором. Движение фрагментов ДНК в капилляре, как и в «классической» методике, происходит под действием тока. Для определения размеров НК, белков используют маркеры. Для анализа необходимо выбрать подходящий, по диапазону длин фрагментов НК, реагентный кит. Затем весь процесс, начиная с ввода образца, заканчивая промывкой микрочипа, производится автоматически. Все результаты обрабатываются с помощью ПО.
Характеристики чипов:
| DNA-500 | DNA-1000 | DNA-2500 | RNA | |
| Объекты исследования | ДНК | ДНК | ДНК | РНК |
| Диапазон размеров НК | 25-500 п.о. | 100-1000 п.о. | 100-2500 п.о. | до 28S рРНК (~5,0 Кнт) |
| Разрешение, % | 5 | 5 | 10 | 20 |
| Точность определения размера НК | ± 5% | ± 15% | ± 15% | n/a |
